Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms