Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GTF2BQ00403 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms