Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TUBB4BP68371 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms