Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF3P61204 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF3P61204 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF3P61204 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF3P61204 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF3P61204 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF3P61204 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF3P61204 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF3P61204 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF3P61204 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF3P61204 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF3P61204 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF3P61204 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF3P61204 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF3P61204 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF3P61204 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF3P61204 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF3P61204 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF3P61204 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF3P61204 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF3P61204 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF3P61204 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF3P61204 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF3P61204 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF3P61204 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF3P61204 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF3P61204 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF3P61204 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF3P61204 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF3P61204 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF3P61204 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF3P61204 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF3P61204 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF3P61204 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF3P61204 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ARF3P61204 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ARF3P61204 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARF3P61204 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARF3P61204 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARF3P61204 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARF3P61204 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARF3P61204 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ARF3P61204 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARF3P61204 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARF3P61204 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARF3P61204 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARF3P61204 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARF3P61204 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARF3P61204 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARF3P61204 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARF3P61204 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ARF3P61204 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARF3P61204 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARF3P61204 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms