Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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UBE2NP61088 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
UBE2NP61088 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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UBE2NP61088 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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UBE2NP61088 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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UBE2NP61088 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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UBE2NP61088 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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UBE2NP61088 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
UBE2NP61088 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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