Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CASP9P55211 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CASP9P55211 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CASP9P55211 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CASP9P55211 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CASP9P55211 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CASP9P55211 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CASP9P55211 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CASP9P55211 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CASP9P55211 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CASP9P55211 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CASP9P55211 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CASP9P55211 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CASP9P55211 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CASP9P55211 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CASP9P55211 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CASP9P55211 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CASP9P55211 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CASP9P55211 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CASP9P55211 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CASP9P55211 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CASP9P55211 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CASP9P55211 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CASP9P55211 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CASP9P55211 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CASP9P55211 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CASP9P55211 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CASP9P55211 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CASP9P55211 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CASP9P55211 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CASP9P55211 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CASP9P55211 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CASP9P55211 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CASP9P55211 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CASP9P55211 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CASP9P55211 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CASP9P55211 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CASP9P55211 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CASP9P55211 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CASP9P55211 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CASP9P55211 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CASP9P55211 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CASP9P55211 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CASP9P55211 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CASP9P55211 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CASP9P55211 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CASP9P55211 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CASP9P55211 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms