Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GEMP55040 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GEMP55040 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GEMP55040 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GEMP55040 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GEMP55040 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GEMP55040 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GEMP55040 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GEMP55040 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GEMP55040 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GEMP55040 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GEMP55040 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GEMP55040 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GEMP55040 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GEMP55040 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GEMP55040 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GEMP55040 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GEMP55040 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GEMP55040 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GEMP55040 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GEMP55040 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GEMP55040 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GEMP55040 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms