Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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PGGT1BP53609 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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PGGT1BP53609 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PGGT1BP53609 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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