Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LHX1P48742 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX1P48742 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX1P48742 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX1P48742 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX1P48742 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX1P48742 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX1P48742 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX1P48742 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX1P48742 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX1P48742 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX1P48742 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX1P48742 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX1P48742 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX1P48742 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX1P48742 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX1P48742 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX1P48742 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX1P48742 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX1P48742 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX1P48742 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX1P48742 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX1P48742 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX1P48742 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX1P48742 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX1P48742 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX1P48742 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX1P48742 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX1P48742 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX1P48742 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX1P48742 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX1P48742 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX1P48742 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX1P48742 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX1P48742 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX1P48742 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX1P48742 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX1P48742 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX1P48742 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX1P48742 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX1P48742 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX1P48742 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX1P48742 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX1P48742 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX1P48742 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX1P48742 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX1P48742 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX1P48742 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX1P48742 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX1P48742 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX1P48742 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX1P48742 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX1P48742 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX1P48742 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX1P48742 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX1P48742 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX1P48742 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX1P48742 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX1P48742 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX1P48742 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX1P48742 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX1P48742 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX1P48742 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX1P48742 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX1P48742 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX1P48742 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX1P48742 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX1P48742 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX1P48742 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX1P48742 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX1P48742 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX1P48742 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX1P48742 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX1P48742 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX1P48742 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX1P48742 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX1P48742 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX1P48742 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX1P48742 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX1P48742 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX1P48742 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX1P48742 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX1P48742 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX1P48742 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX1P48742 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX1P48742 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX1P48742 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX1P48742 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX1P48742 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX1P48742 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX1P48742 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX1P48742 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms