Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK1DP48730 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSNK1DP48730 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms