Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NESP48681 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NESP48681 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NESP48681 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NESP48681 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NESP48681 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NESP48681 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NESP48681 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NESP48681 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NESP48681 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NESP48681 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NESP48681 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NESP48681 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NESP48681 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NESP48681 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NESP48681 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NESP48681 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NESP48681 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NESP48681 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NESP48681 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NESP48681 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NESP48681 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NESP48681 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NESP48681 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NESP48681 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NESP48681 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NESP48681 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NESP48681 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NESP48681 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NESP48681 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NESP48681 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NESP48681 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NESP48681 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NESP48681 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NESP48681 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NESP48681 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NESP48681 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NESP48681 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NESP48681 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NESP48681 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NESP48681 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NESP48681 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NESP48681 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NESP48681 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NESP48681 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NESP48681 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NESP48681 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NESP48681 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NESP48681 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NESP48681 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NESP48681 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NESP48681 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NESP48681 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NESP48681 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NESP48681 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NESP48681 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NESP48681 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NESP48681 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NESP48681 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NESP48681 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NESP48681 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NESP48681 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NESP48681 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NESP48681 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NESP48681 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NESP48681 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NESP48681 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NESP48681 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NESP48681 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NESP48681 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NESP48681 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NESP48681 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NESP48681 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NESP48681 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NESP48681 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NESP48681 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NESP48681 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NESP48681 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NESP48681 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NESP48681 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NESP48681 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NESP48681 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NESP48681 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NESP48681 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NESP48681 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NESP48681 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NESP48681 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NESP48681 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NESP48681 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NESP48681 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NESP48681 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NESP48681 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NESP48681 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NESP48681 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NESP48681 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NESP48681 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NESP48681 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NESP48681 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NESP48681 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NESP48681 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms