Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GRIA4P48058 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms