Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GNPDA1P46926 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms