Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC1A2P43004 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC1A2P43004 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms