Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MDH1P40925 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MDH1P40925 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MDH1P40925 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MDH1P40925 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MDH1P40925 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MDH1P40925 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MDH1P40925 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MDH1P40925 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MDH1P40925 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MDH1P40925 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MDH1P40925 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MDH1P40925 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MDH1P40925 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MDH1P40925 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MDH1P40925 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MDH1P40925 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MDH1P40925 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MDH1P40925 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MDH1P40925 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MDH1P40925 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MDH1P40925 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MDH1P40925 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MDH1P40925 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MDH1P40925 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MDH1P40925 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MDH1P40925 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MDH1P40925 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MDH1P40925 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MDH1P40925 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MDH1P40925 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MDH1P40925 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MDH1P40925 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MDH1P40925 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MDH1P40925 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MDH1P40925 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MDH1P40925 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MDH1P40925 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MDH1P40925 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MDH1P40925 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MDH1P40925 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MDH1P40925 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MDH1P40925 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MDH1P40925 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MDH1P40925 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MDH1P40925 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MDH1P40925 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MDH1P40925 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MDH1P40925 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MDH1P40925 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MDH1P40925 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MDH1P40925 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MDH1P40925 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MDH1P40925 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MDH1P40925 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MDH1P40925 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MDH1P40925 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MDH1P40925 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MDH1P40925 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MDH1P40925 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MDH1P40925 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MDH1P40925 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MDH1P40925 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MDH1P40925 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MDH1P40925 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MDH1P40925 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MDH1P40925 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MDH1P40925 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MDH1P40925 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MDH1P40925 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MDH1P40925 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MDH1P40925 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MDH1P40925 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MDH1P40925 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MDH1P40925 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MDH1P40925 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MDH1P40925 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MDH1P40925 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MDH1P40925 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MDH1P40925 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MDH1P40925 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MDH1P40925 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MDH1P40925 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MDH1P40925 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MDH1P40925 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MDH1P40925 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MDH1P40925 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MDH1P40925 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MDH1P40925 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MDH1P40925 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MDH1P40925 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MDH1P40925 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MDH1P40925 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MDH1P40925 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MDH1P40925 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MDH1P40925 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MDH1P40925 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MDH1P40925 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MDH1P40925 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MDH1P40925 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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