Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL1P40616 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL1P40616 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL1P40616 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL1P40616 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL1P40616 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL1P40616 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL1P40616 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL1P40616 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL1P40616 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL1P40616 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL1P40616 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL1P40616 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL1P40616 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL1P40616 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL1P40616 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL1P40616 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL1P40616 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL1P40616 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL1P40616 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL1P40616 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARL1P40616 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ARL1P40616 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL1P40616 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL1P40616 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL1P40616 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL1P40616 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL1P40616 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL1P40616 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL1P40616 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL1P40616 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL1P40616 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL1P40616 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL1P40616 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL1P40616 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL1P40616 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL1P40616 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL1P40616 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL1P40616 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL1P40616 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL1P40616 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL1P40616 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL1P40616 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL1P40616 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL1P40616 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL1P40616 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL1P40616 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL1P40616 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL1P40616 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL1P40616 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL1P40616 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ARL1P40616 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms