Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX11P35716 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX11P35716 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX11P35716 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX11P35716 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX11P35716 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX11P35716 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX11P35716 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX11P35716 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX11P35716 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOX11P35716 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOX11P35716 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOX11P35716 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOX11P35716 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOX11P35716 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOX11P35716 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOX11P35716 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOX11P35716 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOX11P35716 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOX11P35716 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOX11P35716 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOX11P35716 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SOX11P35716 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX11P35716 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX11P35716 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX11P35716 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX11P35716 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX11P35716 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX11P35716 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX11P35716 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX11P35716 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX11P35716 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX11P35716 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX11P35716 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX11P35716 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX11P35716 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX11P35716 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX11P35716 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX11P35716 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX11P35716 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX11P35716 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX11P35716 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX11P35716 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX11P35716 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX11P35716 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX11P35716 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX11P35716 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX11P35716 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX11P35716 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX11P35716 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX11P35716 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX11P35716 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX11P35716 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX11P35716 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SOX11P35716 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms