Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA4P35212 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA4P35212 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA4P35212 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA4P35212 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA4P35212 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA4P35212 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA4P35212 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA4P35212 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA4P35212 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA4P35212 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA4P35212 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA4P35212 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA4P35212 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GJA4P35212 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA4P35212 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA4P35212 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA4P35212 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA4P35212 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA4P35212 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA4P35212 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA4P35212 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA4P35212 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA4P35212 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA4P35212 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA4P35212 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA4P35212 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA4P35212 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA4P35212 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA4P35212 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA4P35212 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA4P35212 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA4P35212 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA4P35212 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA4P35212 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA4P35212 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA4P35212 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA4P35212 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA4P35212 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA4P35212 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA4P35212 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA4P35212 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA4P35212 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA4P35212 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA4P35212 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA4P35212 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA4P35212 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA4P35212 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA4P35212 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA4P35212 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA4P35212 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA4P35212 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA4P35212 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA4P35212 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GJA4P35212 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA4P35212 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA4P35212 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA4P35212 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA4P35212 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA4P35212 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA4P35212 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA4P35212 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA4P35212 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA4P35212 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA4P35212 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA4P35212 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA4P35212 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA4P35212 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA4P35212 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA4P35212 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA4P35212 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA4P35212 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA4P35212 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA4P35212 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA4P35212 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA4P35212 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA4P35212 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA4P35212 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA4P35212 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA4P35212 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA4P35212 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA4P35212 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA4P35212 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA4P35212 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA4P35212 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA4P35212 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GJA4P35212 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
GJA4P35212 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA4P35212 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA4P35212 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA4P35212 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA4P35212 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA4P35212 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA4P35212 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA4P35212 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA4P35212 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA4P35212 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA4P35212 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA4P35212 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GJA4P35212 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms