Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPC1P35052 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPC1P35052 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GPC1P35052 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPC1P35052 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPC1P35052 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPC1P35052 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPC1P35052 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPC1P35052 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPC1P35052 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GPC1P35052 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPC1P35052 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPC1P35052 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPC1P35052 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPC1P35052 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPC1P35052 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPC1P35052 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPC1P35052 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPC1P35052 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPC1P35052 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPC1P35052 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPC1P35052 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPC1P35052 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPC1P35052 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPC1P35052 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GPC1P35052 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPC1P35052 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GPC1P35052 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPC1P35052 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPC1P35052 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPC1P35052 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GPC1P35052 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPC1P35052 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GPC1P35052 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPC1P35052 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPC1P35052 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPC1P35052 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPC1P35052 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPC1P35052 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPC1P35052 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPC1P35052 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPC1P35052 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GPC1P35052 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPC1P35052 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPC1P35052 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPC1P35052 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPC1P35052 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GPC1P35052 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GPC1P35052 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GPC1P35052 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms