Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
DUSP1P28562 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DUSP1P28562 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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