Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA3P25788 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms