Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATP5F1P24539 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ATP5F1P24539 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms