Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
VAMP1P23763 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms