Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRBP23467 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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