Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PVALBP20472 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PVALBP20472 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PVALBP20472 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PVALBP20472 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PVALBP20472 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PVALBP20472 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PVALBP20472 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PVALBP20472 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PVALBP20472 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PVALBP20472 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PVALBP20472 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PVALBP20472 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PVALBP20472 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PVALBP20472 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PVALBP20472 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PVALBP20472 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PVALBP20472 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PVALBP20472 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PVALBP20472 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PVALBP20472 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PVALBP20472 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PVALBP20472 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PVALBP20472 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PVALBP20472 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PVALBP20472 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PVALBP20472 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PVALBP20472 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PVALBP20472 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PVALBP20472 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PVALBP20472 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PVALBP20472 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PVALBP20472 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PVALBP20472 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PVALBP20472 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PVALBP20472 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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