Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC192P0DO97 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms