Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBSLP0DN79 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms