Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOA4P06727 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOA4P06727 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOA4P06727 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOA4P06727 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOA4P06727 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APOA4P06727 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APOA4P06727 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA4P06727 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA4P06727 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA4P06727 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA4P06727 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA4P06727 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA4P06727 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA4P06727 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA4P06727 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA4P06727 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA4P06727 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA4P06727 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA4P06727 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA4P06727 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA4P06727 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA4P06727 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA4P06727 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA4P06727 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA4P06727 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA4P06727 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA4P06727 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA4P06727 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA4P06727 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA4P06727 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA4P06727 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA4P06727 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA4P06727 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA4P06727 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA4P06727 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA4P06727 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA4P06727 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA4P06727 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA4P06727 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA4P06727 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA4P06727 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA4P06727 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOA4P06727 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms