Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2F6O75461 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F6O75461 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F6O75461 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F6O75461 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F6O75461 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F6O75461 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.05■□□□□ -0
E2F6O75461 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F6O75461 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F6O75461 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F6O75461 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F6O75461 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F6O75461 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F6O75461 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F6O75461 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F6O75461 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F6O75461 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F6O75461 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F6O75461 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F6O75461 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F6O75461 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F6O75461 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F6O75461 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F6O75461 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F6O75461 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2F6O75461 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
E2F6O75461 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F6O75461 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F6O75461 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F6O75461 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F6O75461 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F6O75461 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F6O75461 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F6O75461 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F6O75461 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F6O75461 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F6O75461 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F6O75461 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F6O75461 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F6O75461 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F6O75461 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F6O75461 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F6O75461 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F6O75461 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F6O75461 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F6O75461 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F6O75461 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F6O75461 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F6O75461 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F6O75461 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F6O75461 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.04■□□□□ -0
E2F6O75461 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F6O75461 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F6O75461 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F6O75461 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F6O75461 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F6O75461 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F6O75461 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F6O75461 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F6O75461 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F6O75461 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F6O75461 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F6O75461 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.04■□□□□ -0
E2F6O75461 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F6O75461 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F6O75461 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F6O75461 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F6O75461 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F6O75461 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F6O75461 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
E2F6O75461 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2F6O75461 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F6O75461 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F6O75461 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F6O75461 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F6O75461 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F6O75461 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F6O75461 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F6O75461 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F6O75461 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F6O75461 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F6O75461 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.03■□□□□ -0
E2F6O75461 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F6O75461 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F6O75461 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F6O75461 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F6O75461 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F6O75461 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F6O75461 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F6O75461 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F6O75461 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F6O75461 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F6O75461 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E2F6O75461 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F6O75461 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F6O75461 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.03■□□□□ -0
E2F6O75461 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.03■□□□□ -0
E2F6O75461 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F6O75461 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
E2F6O75461 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms