Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NIPSNAP2O75323 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms