Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCN2BO60939 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCN2BO60939 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCN2BO60939 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCN2BO60939 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCN2BO60939 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCN2BO60939 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SCN2BO60939 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCN2BO60939 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCN2BO60939 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SCN2BO60939 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCN2BO60939 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SCN2BO60939 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SCN2BO60939 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCN2BO60939 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SCN2BO60939 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCN2BO60939 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCN2BO60939 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SCN2BO60939 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SCN2BO60939 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCN2BO60939 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCN2BO60939 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SCN2BO60939 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SCN2BO60939 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCN2BO60939 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCN2BO60939 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SCN2BO60939 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCN2BO60939 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCN2BO60939 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCN2BO60939 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SCN2BO60939 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SCN2BO60939 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCN2BO60939 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SCN2BO60939 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SCN2BO60939 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SCN2BO60939 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SCN2BO60939 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SCN2BO60939 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCN2BO60939 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCN2BO60939 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SCN2BO60939 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCN2BO60939 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCN2BO60939 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCN2BO60939 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCN2BO60939 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCN2BO60939 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCN2BO60939 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCN2BO60939 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCN2BO60939 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms