Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSL4O60488 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms