Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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LRRTM2O43300 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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LRRTM2O43300 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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LRRTM2O43300 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LRRTM2O43300 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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