Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFS4O43181 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms