Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRTO14522 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
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