Protein–RNA interactions for Protein: C9J366

IQCJ-SCHIP1, IQCJ-SCHIP1 readthrough, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCJ-SCHIP1C9J366 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IQCJ-SCHIP1C9J366 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms