Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ERVV-1B6SEH8 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms