Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF839A8K0R7 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF839A8K0R7 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF839A8K0R7 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF839A8K0R7 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF839A8K0R7 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF839A8K0R7 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF839A8K0R7 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF839A8K0R7 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZNF839A8K0R7 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms