Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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ARL2-SNX15V9GYD0 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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