Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC8Q9Y2L5 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms