Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PADI4Q9UM07 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms