Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CPA4Q9UI42 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms