Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APEX2Q9UBZ4 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APEX2Q9UBZ4 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms