Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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