Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CPNE7Q9UBL6 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CPNE7Q9UBL6 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CPNE7Q9UBL6 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CPNE7Q9UBL6 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CPNE7Q9UBL6 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CPNE7Q9UBL6 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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