Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DDIT4Q9NX09 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms