Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED17Q9NVC6 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED17Q9NVC6 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED17Q9NVC6 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED17Q9NVC6 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED17Q9NVC6 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED17Q9NVC6 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED17Q9NVC6 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED17Q9NVC6 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED17Q9NVC6 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED17Q9NVC6 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED17Q9NVC6 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED17Q9NVC6 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED17Q9NVC6 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED17Q9NVC6 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MED17Q9NVC6 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED17Q9NVC6 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED17Q9NVC6 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED17Q9NVC6 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MED17Q9NVC6 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED17Q9NVC6 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms