Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMBRD1Q9NUN5 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms