Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SNX15Q9NRS6 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms