Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBQLN4Q9NRR5 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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UBQLN4Q9NRR5 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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UBQLN4Q9NRR5 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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UBQLN4Q9NRR5 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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UBQLN4Q9NRR5 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
UBQLN4Q9NRR5 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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